Toplu dışa aktarma seçenekleri, dışa aktarılacak biçimi ve klasörü ve kullanılacak uzantıyı belirlemenize olanak tanır. Her dosya Geneious'daki Ad sütununa göre adlandırılacaktır. Klasörü Dışa Aktar: Bir klasörün tamamını tek bir dosyaya aktarmak için Kaynaklar panelindeki klasöre tıklayın ve Dosya → Dışa Aktar → Klasörü Dışa Aktar seçeneğine gidin.